江蘇省發改委于2016年批準，依托南京審計大學建設江蘇省審計大數據工程實驗室，主管單位是江蘇省審計廳，是南京審計大學第一個獲批的江蘇省工程實驗室，2021年通過考核轉為江蘇省審計大數據工程研究中心。目前工程研究中心聚焦“大數據審計、數智審計”工程化應用研究，依托信息技術發展，致力于審計領域科技創新。

工程研究中心組建了大模型人工智能審計應用、大數據審計工程化實施等研究方向團隊，擁有專職研究人員21人，其中在編研究人員9人，客座研究人員12人，其中包含國家千人計劃人才1名、教授3名、博士生導師2名、碩士生導師9人，科研實力雄厚。

近三年，工程研究中心作為主要參與單位和參與人編制發布GB/T 42584-2023“信息化項目綜合績效評估規范”；T/CITIF001-2024“數據合規審計指南”等多項國家標準，獲發明專利3項，在核心期刊上發表論文50余篇，其中被SCI等收錄30余篇。工程研究中心成員主持科研項目20項，其中國家基金項目3項，科研經費800萬元；為國家審計機關、國央企提供大數據審計技術服務，經費超過500萬元，成果顯著。